Die Länder Nordafrikas, die Golfstaaten und der Iran sind für Deutschland und die Europäische Union vor allem aus energie- und sicherheitspolitischer Sicht von großer Bedeutung. Die Sicherung der Energiezufuhr, die Bekämpfung von illegaler Migration, Drogenhandel, transnationalem Terrorismus und die Verbreitung von Massenvernichtungswaffen spielen in diesem Zusammenhang eine wichtige Rolle. Dabei ist die EU von den südlichen Mittelmeeranrainerstaaten nur durch eine Schengengrenze getrennt. Staaten wie Marokko, Algerien, Tunesien, Ägypten, Jordanien oder Libanon sind zudem Partnerstaaten in der Europäischen Nachbarschaftspolitik und der „Union für das Mittelmeer“.
Religiös geprägte oder innerstaatliche Konflikte, transnationaler Terrorismus und der Konflikt zwischen Israel und den Palästinenser sowie die iranische Nuklearpolitik stellen Europa vor außerordentliche Herausforderungen. Die Arbeit des Programms konzentriert sich darauf, die Informationen bereit zu stellen, die die Komplexität dieser vielfach miteinander verknüpften Konflikte verständlich aufbereiten, sowie Vorschläge für Lösungsstrategien zu erarbeiten.